磺胺药是1932年问世后用于流脑的特效药。在治疗过程中观察到脑膜炎双球菌对磺胺的敏感性下降。二次大战后美国已观察到磺胺在b及c群菌中的耐药率不断上升。1963年及1970年美国和摩洛哥分别报告了耐药13群菌和c群菌引起的流行。

当磺胺药对脑膜炎菌体外试验的最小抑制浓度＞10—50微克/毫升时，就算耐药。根据这个标准衡量，a群在欧洲，c群在美国的耐药率均达80%一90%；巴西圣保罗报道1973年c群流行时的耐药率达95%；挪威报道1971年前72%的脑膜炎菌对20微克/毫升的磺胺药是敏感的；而1973年后则为92%的脑膜炎菌对100微克/毫升的磺胺药均产生耐药。近年非洲尼日利亚已报道该地区脑膜炎菌的耐磺胺率达30%；乍得达70%。我国在60年代已报道了耐药菌株的出现，目前一般耐药率在10%一20%。但已有报道a群菌的耐磺胺率：在磺胺嘧啶100微克/毫升时占50.6%。可见脑膜炎菌对磺胺的耐药问题是流脑防治中的一个世界性问题。由于耐药株的日益猖狂，导致流行中发病率及病死率上升；在预防上用磺胺药已多次证实无效。

在治疗上由于磺胺药经济，80%的菌群在我国尚敏感，所以尚属首选药物，但如临床疗效不佳时，应在治疗36小时后立即换用其它抗生素。